圣芳济各书院是天主教香港教區屬下的津貼中學，為一所全日制的男女校。現時中一至中三級採用母語教學，中四至中六級則用母語或英語授課。本校於一九七七年在九龍石硤尾南昌街創校，後於一九九三年九月一日開始遷往新界粉嶺欣盛里一號，至一九九七年完成整個遷校過程。
圣芳济各书院秉承天主教的辦學理念，引導學生認識基督福音的精神，效法聖人方濟各的芳表，並在生活中實踐「敬主愛人，和平美善」的校訓。除傳授知識外，尤著重陶冶學生品格，培育學生的自律及自學精神，教導學生熱愛家庭，關心社會，服務人群。本校亦鼓勵學生積極參與課外活動，藉以發展個人潛能，培養群體合作的精神。
学校特色
1) 初中实行小班教学，密切照顾学生的学习差异和成长需要;高中核心科目分组教学，提升学习水平。
2) 推行牧民工作，设有全职牧民助理，提升学生的灵性生活，实践基督精神。
3) 校风严谨，纪律严明，中一至中三留校午膳，训练学生自律守规。
4) 设双班主任，透过班主任的关顾，培育学生正确的态度和行为。
5) 为培育中一同学自律自学及克己守规，并能发展多方面的兴趣，全校中一同学必须参加下列计划：
1. ‘一人一乐器’计划：所有中一级同学须从中乐团、结他队、口琴队及合唱团选择一项参与，费用由学校资助。
2. ‘一人一活动’计划：所有初中级别同学须由30多项课外活动中选取最少一项参与。
