它是18世纪启蒙运动的产物。1777年，人们就在波恩建立了一所高等学校----科隆公国学院，以促进蓬勃的启蒙运动继续发展，1784年又把它改建为大学，这就是波恩大学的前身。不久，拿破仑一世进攻德国，莱茵地区被占，波恩失守。由于法国人带来了全新的资产阶级民主思想，因而使这所学校成为封建保守思想和自由的意识形态论争的大讲坛。拿破仑失败后，波恩重归普鲁士统治。在当时著名进步思想家洪堡创议、普王弗里德利希·威廉三世帮助下，学校于1818年10月成为普鲁士的正规大学，政府接管了学校。1828年，学校将捐助者的名字作为学校校名，即莱茵波恩弗里德利希·威廉大学，简称波恩大学。至此，学校各领域的发展开始进入了正轨。
自然学科主要集中在泊波尔多夫区，泊波尔多夫宫殿和19世纪的现代办公楼为主。泊波尔多夫宫殿花园自1819年作为植物园存在。计算机学科分布在两个位置。老的供给中心和国家机关楼（前警察总部等）。心理学位于城北的LVR医院。医药学位于费努斯贝格。个别机构和设施分布在其他城区如天文学，化学和部分医药学。
办学规模
是一 所综合性高等学校。前身为1777年科隆公国在科隆市成立的马克斯学院，1784年改为大学。1798年后曾关闭。1818年普鲁士政府命令在波恩原选帝侯宫重建。1828年改用现名。波恩大学以柏林大学为榜样，于1827年颁布章程，强调教学与研究相结合，尊重学术自由为办学指导原则。纳粹统治时期 ，遭到严重破坏。第二次世界大战后，学校得到迅速恢复和发展。设有基督教神学院、天主教神学院、数学和自然科学学院、医学院、哲学院、法学和经济学院、农学院、教育学院。设有水利法研究所，动力法研究所，马克斯·普朗克射电天文研究所 ，储蓄、汇兑和信贷业研究所，莱茵-威斯特伐利亚工具数学研究所，东方语言研究室等。其中法科、哲学科和医科（尤其是医学外科）是波恩大学著名的学科。马克思曾于1835～1836年在此学习。
机构设置
学校现有8个学院，即：基督教神学院、天主教神学院、法律经济学院、医学院、哲学院、数学自然科学学院、农学院和教育学院。另外设有各类校直属研究机构十几个，如考古研究所、语言实验中心、天文学研究中心等等。
波恩大学的确拥有许多校直属科研机构，作为对教学和研究任务的补充。它们是：弗朗兹－杜尔格尔研究所，成立于1966年，研究古希腊罗马后期情况，尤其是地中海古代文化的过渡阶段。研究所的许多工作人员都是来自外国的专家。旧天主教神学研究班，成立于1901年，由主教研究班和波恩旧天主教教堂资助，是德国迄今为止唯一的旧天主教研究机构，它致力于培养旧天主教教学和研究的后备力量。东方语言研究班，成立至今才25年，它对于波恩大学，这所曾位于德国政治中心的高校来说，尤其具有特殊意义。自1979年来，它在经济上一直受到联邦政府和北莱茵-威斯特法伦州的资助，主要从事近东、中东、远东语言文化人才的培养。1983年，研究所还开设了土耳其语、日语、汉语、朝鲜语、印度语和阿拉伯语的笔译课程。法国文化研究中心是法国使馆于1952年成立的。它的师资力量和研究人员及活动经费大部分得到法国外交部的资助。中心建立目的在于促进德法两国互相谅解和两国学生、学者、作家和艺术工作者的交流。目前工作重心是加强波恩大学法国语言和文学教学和研究水平。计划用水法研究所是德国唯一致力于用水平衡法和水利法的实施的科研机构。它通过指导和建议不断对联邦和州立法机关施加影响，使水法实施条件不断改善，同时它还负责水利法的推广和研究。银行储存和贷款研究所主要从事银行储蓄、利息、贷款和结算的研究工作。
与波恩大学有着密切联系的马克斯-普兰克研究协会在全球享有极高的威望，主要从事自然科学研究。研究协会有两个研究中心：马克斯-普兰克-射电天文学研究中心，致力于太阳系、银河系和外空间射电源的研究，并拥有世界上最大最先进的射电望远镜；马克斯-普兰克数学研究中心成立于1982年，它的主要课题是研究理论数学。
和医学院有关的几个研究单位是全国医学实验和放射助理学校（从事微生物和免疫学研究）、病人护理学校、儿童护理学校和病人护救学校等。
在德国，“大学城”是波恩市的代名词。随着德国首都北迁入柏林，波恩将进一步朝文化性多功能的城市发展，这无疑为波恩大学学术研究提供了机会。
院系设置
学校现有8个学院，即：基督教神学院、天主教神学院、法律经济学院、医学院、哲学院、数学自然科学学院、农学院和教育学院。另外设有各类校直属研究机构十几个，如考古研究所、语言实验中心、天文学研究中心等等。文科：埃及学、考古学、古美语文学、拜占庭语、专业翻译、法语、地理、日尔曼语、历史、食品营养学、印度日尔曼语、印度语、信息学、意大利语、日语、凯尔特语、公共关系学、比较文学、国家历史、艺术历史、文学、蒙古语、音乐学、北美研究、东方艺术史、教育学、哲学、政治学、葡萄牙语、心理学、俄语、罗马尼亚语、闪米特语、汉学、斯堪地那维亚语、社会学、社会经济学、语言学、法学、体育、民族学、经济历史等。
理科：天文学、生物学、食品化学、食品技术、数学、医学、气象学、药剂学、物理学、东南方学、测量学、牙医、化学等。
科研重点
* 数学
* 材料结构
* 生命科学
* 医学
* 环境科学
* 信息和通讯科学
* 欧洲学
* 经济
* 经济学
* 地区发展研究
波恩大学实验经济学实验室
波恩的经济学研究规模是全德国最庞大的之一。波恩大学实验经济学实验室(简称为BonnEconLab)是欧洲最早的实验经济学实验室,由诺贝尔奖得主泽尔腾(R.Selten)创建。它在实验经济学研究方面取得的成果令人瞩目,是全球实验经济学研究的重镇。该实验室是隶属于波恩大学法与经济学院的经济系的一个服务性部门,它的主要使用者是波恩大学经济系的研究人员和波恩大学的研究生。实验室负责给予研究人员在实验计划、设计、运行方面以帮助和建议。在波恩大学经济系的研究和教学活动中,它为经济学专业的本科、硕士、博士生教育发挥着重要的作用。
为了了解波恩大学实验经济学实验室的由来,我们需要先介绍一下泽尔腾在实验经济学研究方法方面的探索过程。20世纪50年代,泽尔腾被法兰克福大学的经济学家海因茨· 萨尔曼(HeinzSauermann)聘为助手,在这期间,泽尔腾即迷上了关于经济学的实验工作,并得到萨尔曼的支持。当时,泽尔腾正在从事寡头博弈的实验探索,在泽尔腾与几个年轻同事从事经济学的实验室研究工作期间,萨尔曼凭着对经济学发展趋势的把握以及对经济学的直观感受,给予泽尔腾很多很好的指导性建议。
1959年,泽尔腾与萨尔曼合作发表了他的第一篇学术论文《一个有关寡头的实验》。虽然当时并没有实验经济学这门学科,但大学期间的心理学课程对于泽尔腾开展实验工作具有巨大的帮助。1961年,泽尔腾获得法兰克福大学数学博士学位后,对西蒙(H.A.Simon)的有限理性学说产生了浓厚的兴趣,他试图构造一个有限理性多目标决策理论。为此,泽尔腾去美国做了两年访问学者,并与西蒙及其助手建立了联系。他投入了很多时间研究有限理性问题,但并没有取得多少进展。在这个令人烦恼的过程中,泽尔腾越来越强烈地认识到,要构造有限理性的经济行为理论,必须通过实验的方法,而不是传统的理论推导方法。
起初,泽尔腾的计划是建立一个大型的数理经济学研究所,后来由于资金方面的限制,他只建成了一个小型的实验研究机构。在这个实验性的机构里,他与博弈论专家合作并取得了一系列的研究成果。他通过独特的实验室研究方法开展研究活动,主要关注的领域是博弈理论及其在产业组织与其他领域的应用。当时,所在的比勒菲尔德大学鼓励各学科之间的交叉研究,其他领域的一些具有较少数学训练的科学家给予了泽尔腾其他方面的启发。他发现,政治学家能根据历史经验,对政治活动过程做出一系列正确的判断,而这些理论并不受数学模型的制约;生物学家、心理学家都有各自的非数学理论模型。这些学科的启发促使他建立一个专门开展实验经济学研究的计算机实验室。此时,波恩大学伸出了橄榄枝,于是泽尔腾于1984年来到波恩大学并创建了BonnEconLab。BonnEconLab是实验经济学的创新研究中心,固定的管理及研究人员有4人,学生助理有3人,还有一些不定期的访问研究员。实验室早期主要关注行为博弈理论,后来也关注有限理性的实验。实验室研究人员在国际顶级学术刊物上发表了大量的科研成果,这些科研成果主要集中在拍卖和市场、竞价、劳动经济学、卫生经济学、公平互惠、跨文化实验和神经元经济学等领域。
